Två sorters färjor delar på vattnet runt Stockholm: SL:s pendelbåtar med vanlig kollektivtrafikbiljett och de gula vägfärjorna där bilen kör rakt ombord.
Innanför tullarna är båten en del av SL-nätet. Djurgårdsfärjan och linjerna 80, 84 och 89 tar samma biljett som bussen och tunnelbanan, och tidtabellerna byts vid samma datum som resten av sjötrafiken – flera av dem gäller just nu till mitten av december.
Ute i länet är det vägnätet som fortsätter över vattnet. Trafikverket Färjerederiet kör lederna till Rindö och Vaxholm, till Ljusterö, Adelsö och Mörkö, och de flesta kostar ingenting att åka med. Ekeröleden mellan Slagsta och Jungfrusund är undantaget: där är Ekerö kommun huvudman, och den som kör bil betalar för överfarten.